Dr. Kemal Naci Ekşi Anadolu Lisesi, 1988’de Bakırköy Belediye Başkanı Dr. Kemal Naci Ekşi’nin desteği ile yaptırılarak hizmet vermeye başlamıştır.

1988/1989 eğitim-öğretim yılında eğitime başlayan okulumuz ilk açıldığı yıllarda hem ortaokul hem de lise olarak eğitim vermiştir.

Okulumuz, 1994/1995 yılından itibaren Genel Lise, 2001/2002 öğretim yılından itibaren ise Genel Lisenin yanında Yabancı Dil Ağırlıklı Lise olarak da 2005/2006 yılına kadar hizmet vermiştir.

Okulumuz 2005/2006 öğretim yılından itibaren Anadolu Lisesi olarak eğitim vermeye başlamıştır.

2005 yılında deprem riski sebebiyle yıkılarak yeniden yapılmasına karar verilen okul binamız İl Özel İdaresi İstanbul Proje Koordinasyon Birimi (İPKB) tarafından Dünya Bankası kredisi ile tekrar yapılmıştır.

2008 yılında inşaatı tamamlanan okulumuz, yeni binası ile eğitim-öğretime devam etmektedir.